Les syndromes de Kosaki et de Penttinen sont dus à des variants activateurs hétérozygotes du gène PDGFRB, qui peuvent être de novo (accidentels) ou hérités d'un parent. Ce gène code pour une protéine, PDGFRβ, qui joue un rôle essentiel dans le développement des tissus et des organes, étant impliquée dans les processus de prolifération et de division cellulaires dans des tissus tels que la peau, les os et les vaisseaux sanguins.

 

Lorsqu'un variant survient, cette protéine est active en permanence, ce qui entraîne une dérégulation des processus de prolifération et de division cellulaires et explique les symptômes. Des variants de ce gène ont également été signalés chez des patients atteints de myofibromatose, une tumeur bénigne rare des tissus mous caractérisée par le développement de nodules dans la peau, les muscles, les os, etc. et qui peut être constatée chez les patients porteurs de syndrome de Kosaki et de Penttinen ainsi que dans les cas d'anévrismes vasculaires.